益生菌的作用概括为以下10个方面

维持肠道正常功能，缓解乳糖不耐受症状，促进消化吸收，增强人体免疫力，预防癌症和抑制肿瘤的生长，缓解过敏反应，降低血清胆固醇，益生菌对肥胖的作用，益生菌对糖尿病的作用，益生菌对脑及行为作用等等。

近几年来，科学家对肠道菌群对人类的有益性进行了大量研究，揭示肠道微生物如何帮助改善宿主的机体健康以及帮助预防疾病，研究者发现益生菌中的重要成员--鼠李糖乳杆菌（Lactobacillus rhamnosus GG，LGG），可以帮助治疗肠道问题、呼吸道感染以及某些皮肤障碍，而且还发现该菌可以帮助减肥。那么LGG是否可以真的给人类带来好处呢？

马里兰大学医学院的研究人员在mBio杂志上刊登了最新研究成果，发现LGG可以扮演一种推进者的角色，来修饰其它肠道细菌的活性：研究对12名受试者进行了测试，参与者连续28天每天摄入两次LGG，分别分析疗程前和疗程后的肠道菌群，结果发现，摄入LGG可以增加许多基因的表达，进而促进其它肠道菌群的生长，包括拟杆菌属、双歧杆菌属等菌群，这些菌群都被认为对人类有益处，包括可以促进免疫系统的健康发育等。

奥克兰大学的研究者Rinki Murphy发现，极低热量饮食及益生菌的摄入或可帮助有效抑制2型糖尿病的发生。特定的益生菌菌种抑制糖尿病的效应可以帮助有效降低妊娠糖尿病的发生，并且可以改善患者的胰岛素敏感性及体重情况。抑制2型糖尿病，间歇性禁食可以通过补充鼠李糖乳杆菌益生菌使有益效应被放大。

关于补充益生菌的作用，在过去的几十年中，有几千项相关的研究发表，其中益生菌相关的临床研究的数量也在逐年上升。在针对肠道调节、调节免疫、缓解过敏、抑制癌症以及女性健康等方面，都有许多积极的实验结果。虽然大多数被声称的功效仍欠缺充足的证据，但也几乎没有副作用的报道。

美国微生物学会曾组织了一个益生菌研讨会，会议总结明确指出：“迄今为止，绝大多数益生菌在人体中的使用对于疾病处理而言都是预防和支持性的，而不是治疗性的”。英国国家医疗服务体系（NHS）认为，具有比较强的证据证明益生菌能预防抗生素相关性腹泻（ADD）；比较弱的证据证明益生菌可能有助于治疗肠易激综合征（IBS）、乳糖不耐受和治疗溃疡性结肠炎的并发症；此外益生菌可能有助于保护一些早产儿不发生肠道疾病；而其它的有助于婴儿肠绞痛、增强免疫、重新平衡肠道菌群、炎症性肠炎（IBD）、湿疹等都证据不足。2010年之后，欧洲食品安全局（EFSA）不再允许食品企业声称益生菌饮品能“增强免疫系统”。2014年9月，欧盟食品安全局就肠道和免疫健康声称指南的修订开始征求意见。