肠道菌群又可分为共生菌、条件致病菌和致病菌

共生菌

一般都是专性厌氧菌，占据了肠道菌群所有细菌数量的99％以上，绝大部分的细菌隶属于厚壁菌门和拟杆菌门，是肠道菌群的主体。

人体为共生菌提供生存场所和营养，而这些细菌如双歧杆菌、乳酸杆菌、拟杆菌等，则为人体：

产生有益的物质，如双歧杆菌，乳酸杆菌等能合成多种人体生长发育必须的维生素，如B族维生素（维生素B1、B2、B6、B12），维生素K，烟酸、泛酸等；

还能利用蛋白质残渣合成必需氨基酸，如天冬门氨酸、苯丙氨酸、缬氨酸和苏氨酸等；

参与糖类和蛋白质的代谢，同时还能促进铁、镁、锌等矿物元素的吸收。

这些营养物质对人类的健康有着重要作用，一旦缺少会引起多种疾病。

条件致病菌

在肠道菌群内数量较少。在正常条件下，由于大量共生菌的存在，条件致病菌并不容易大量繁殖以致对人体造成危害。大多数常见的条件致病菌是肠球菌和肠杆菌。

致病菌

一般不常驻在肠道内，但人体若不慎摄入，它们则可能在肠道内大量繁殖，导致疾病的发生。常见的致病菌有沙门菌和致病性大肠埃希菌等。

“健肠长寿”是70多年前日本京都大学代田博士提出的。他认为人体衰老的原因之一就与肠道的衰老直接相关，有害菌增加，就会造成菌群的失调，有害细菌分解代谢食物残渣和产生的有害毒素，使机体中毒，肠道就衰老，“肠道年龄”远大于实际年龄。与我们研究发布的国人0-100岁肠菌群基因图谱正好是一致的。为此，人类的健康和长寿，应把衰老阻止在肠道内，益生菌在人体肠道菌群平衡中就起到了非常关键性的作用。

2.益生菌的作用或功效

近二十年来，由于测序技术的提高，科学界越来越关注肠道菌群的研究。发现益生菌可以帮助消化吸收，促进肠道菌群平衡，维护人体健康。很多的证据表明，不同的人具有着不同的肠道菌群组成，饮食、药物以及环境因素都可以影响到个人肠道菌群的组成；益生菌对于人体的健康影响不仅局限于肠道，还有更广的作用，如免疫平衡调节，还对大脑、肝脏这样的器官产生影响，肠道菌群紊乱与许多诸如糖尿病、肥胖症、抑郁症等慢性疾病有关。同时，人体也对肠道菌群有影响，如情绪、作息会干扰肠道菌群平衡等。数以百计的研究表明不同种类的益生菌赋予不同的健康益处。《益生菌（凯西亚当博士著）》：补充益生菌有超过100种效益。