2岁以下的婴幼儿、服用抗生菌的人、消化道屏障出现问题的人等群体不建议服用益生菌。
益生菌对肠道调节、调节免疫、缓解过敏、抑制癌症以及女性健康等方面,都有许多积极的效果,但2岁以下的婴幼儿,不建议补充益生菌,因其肠道菌群正处于建立期间,服用益生菌可能会影响菌类动态平衡,影响肠道功能。服用抗生素的人群不宜服用益生菌,因为抗生素会把益生菌杀死从而导致失效。胃酸分泌过多的人、胃肠道手术后的病人、胃肠肿瘤患者以及严重炎症性肠病、肝硬化腹水病人等消化道屏障出现问题的人也不建议服用,益生菌不易在肠道中定殖扩散发挥作用。